tak jak kolega @kawaled6 napisał PrusaSlicerem drukujesz wolniej dodatkowo plik jest mniejszy i mniej instrukcji na jedną warstwę.
Myślę, że to powoduje, że przy większej prędkości drukarka nie wyrabia z obliczaniem kolejnych komend. Zauważ, że odcinki okręgu masz podzielne na bardzo małe fragmenty:
Czyli na oko jedna komenda to ruch o jakies 0.4mm

i ten gcode, z którego dobrze.

Powiedz nam jaka to drukarka, jaka elektronika. Wrzuć plik STL tego walca.

Może być kilka kwestii. Pierwsza, najbardziej prawdopodobna, to zbyt duża rozdzielczość łuków w stosunku do możliwości firmware.