Może coś mu się pomerdało przy zapisie ustawień i teraz jak startuje przy odczycie błędnego pliku dziwnie się wywala. Sprawdź czy wywalenie ustawień coś zmieni... bo jak to jest to to nawet przeinstalowanie nic nie da... Ewentualnie dla testu możesz odpalić podając nowe miejsce gdzie ma zapisać ustawienia np. slic3r.exe --datadir C:\twoja_folder_gdzie_zapisac_ustawienia