Ja bym rozwiązał ten problem ustawieniami w slicerze.
Przede wszystkim możesz ustawić podnoszenie się Z przy retrakcji i wymuszenie retrakcji przy każdej zmianie warstwy: Kolejna rzecz to odpowiednie dobranie mnożnika ekstruzji: Prawdopodobnie musisz go zmniejszyć, ale sprawdź i upewnij się, że wartość jest odpowiednia.
Jak nie wiesz jak to się za to zabrać to skorzystaj z tego poradnika: https://teachingtechyt.github.io/calibration.html#flow