jeżeli "zniknięcie" USB i jego ponowne połączenie nie propaguje się poprawnie do kontenera, to chyba spróbowałbym to obejść ser2net.
pewnie trzeba by dłubnąć w samym octoprint, albo dołożyć jakiś socat po drodze, ale wtedy cokolwiek jest w kontenerze może mieć wywalone, bo gada sobie po tcp.

To jest, jeśli już zdecydowałbym się na konteneryzację;)

a nie wystarczy sie zbindować na różne porty?