Ale teraz nie masz podpór w otworach?

Faktycznie. Tak to może działać. Obszar, dla którego wygenerowane zostały te podpory, nie znajduje się wewnątrz mesha.

Tak dla formalności: możesz dodać mesh blokujący w danym miejscu generowanie podpór.

Ale tutaj ustaw po prostu horizontal expansion dla podpór na zero. To jest prawdopodobnie kontynuacja tych podpór, które masz w otworach.